La Maestría en Tecnologías de Información es un programa profesionalizante en el que los estudiantes pueden elegir especializarse en las áreas de sistemas de información o telecomunicaciones seleccionando de un conjunto de cursos, los que les resulten más atractivos. Los profesores que imparten los cursos cuentan con amplio reconocimiento profesional, académico y en investigación, algunos de ellos son miembros del Sistema Nacional de Investigadores. Este programa busca la participación activa del estudiante en el entorno social del área de sistemas de información, aplicando las tecnologías de vanguardia en la administración de ésta, de las telecomunicaciones y de las redes de computadoras. Así mismo, pretende reforzar la vinculación entre la Universidad de Guadalajara y las empresas mediante el desarrollo de proyectos de colaboración para una aplicación más eficiente de las tecnologías de información y áreas afines. La Maestría en Tecnologías de Información tiene colaboración con diversas instituciones del extranjero, como la Universidad de Rostock, Alemania, la Universidad de Biarritz y el Institut TÉLÉCOM Sudparis en Francia, entre otras, lo que permite el desarrollo de proyectos conjuntos y el intercambio de estudiantes y profesores.